长跑是一项气量大、持续时间长的运动。在长跑过程中，肌肉活动剧烈，需要更多的氧气。因此，呼吸频率必须大幅加快。如果呼吸方法不正确，就无法有效地促进气体交换和血液循环，容易过早疲劳，难以跑完较长的距离。有时甚至会导致呼吸器官炎症、喉咙痛或咳嗽。
那么，哪种呼吸方法对健身更有利呢？有人认为应该用鼻子呼吸，而不能用嘴巴呼吸。还有人认为仅仅鼻子呼吸是不够的，必须同时用鼻子和嘴巴呼吸。
这两种说法都有一定道理，但适用于长跑的哪个阶段以及跑步速度快慢还有待考虑。
一般来说，在长跑开始阶段或跑得很慢时，尤其是在冬天练习长跑或逆风跑时，应该用鼻子呼吸。因为鼻腔内有丰富的血管，能够略微加热通过的空气；鼻粘膜分泌液体，可以增加通过的空气湿度；此外，鼻毛和鼻粘膜的分泌液还可以阻挡和清除尘埃和细菌，对呼吸道起到一定的保护作用。
使用口呼吸虽然能够吸入更多空气，但大量冷空气进入气管和喉咙可能导致咳嗽、气管炎和腹痛。用口吸气会直接将空气中的灰尘和细菌吸入体内，这可能导致其他疾病。
然而，在跑过一定距离或速度加快后，尤其是在长跑比赛中，单位时间内的通气量需要增加几倍甚至几十倍，而仅仅使用鼻子呼吸无法满足需求，会感到喘不过气来。这时就必须同时使用鼻子和嘴巴呼吸。
同时使用鼻子和嘴巴呼吸时，需要注意嘴巴不能张得太大，应该是用鼻子吸气，嘴巴呼气。口呼气的方法是：微微张开嘴巴，轻轻咬住牙齿，舌尖卷起，轻轻触碰上颚，让空气从牙缝中流出。在呼吸过程中，要保持均匀而有节奏的呼吸。呼气要短促而有力，适度加深，吸气则要缓慢而均匀。
此外，呼吸还应与步伐密切配合，才能更好地满足身体对氧气的需求，让跑步感觉更轻松自然。配合的方法可以是：两步呼气，然后两步吸气；或者三步呼气，然后三步吸气。在中途加速或比赛最后冲刺时，呼吸深度和节奏可以随着步伐的加快而相应加深和加快。